Автомобиль ГАЗ-3309 является среднетоннажным грузовиком, способным перевозить до 4,5 тонн груза. В отличие от модели 3307, где использовался карбюраторный двигатель, ГАЗ-3309 комплектуется дизельным двигателем ММЗ Д-245.7 мощностью 117 л.с.

Бортовой вариант этого грузовика имеет откидные борта и может комплектоваться тентом. Существуют также модификации, построенные на удлиненном шасси.

На базе ГАЗ-3309 изготавливаются изотермические фургоны, в том числе и с холодильными установками. Широко используются и мебельные (промтоварные) фургоны на основе этого грузовика.